5月12日下午2时28分，四川汶川发生7.8级地震，西安地区震感强烈。地震发生后,二附院紧急启动应急预案，院领导第一时间赶到北院医疗区指导病人疏散。王子明院长和贺西京、张军、李宗芳副院长组织相关部门负责人和病区护士长临时开会布置具体疏散宜,并到各疏散地进行巡视，现场指导解决问题。最后又动员党政、后勤科室的正副主任整夜坚守阿在医院，临床科室主任和护士长坚守病区，随时应付可能出现的紧急情况。
地震时，第一手术室有四台手术正在进行中，手术过程中，房屋晃动明显，但所有手术人员全部镇定自若，未离开手术台一步，晃动过后，大家继续进行手术，直至将手术做完，将病人送至安全地带。据东手术室值班的贺玲芳护士介绍，地震时，手术室的一个二氧化碳钢瓶晃动严重。为防钢瓶倒地，护士徐仁艳上前紧抱钢瓶，以防倒地发生爆炸。二附院医务人员在关键时候忘记生死、关照病人的行为赢得了疏散的病人及家属内心的感激和尊敬。
晚上10时许，接省卫生厅紧急通知，二附院以最快速度组建了由6个医生、3个护士组成的9人医疗队，随时听候调遣赶往灾区救援。